生态保育区面积110公顷，生态保育区完整保留由水中离岛，半岛沼泽，莲菱水塘为核心的鸟类生态系统，外围区的生态系统以修复为主，增植鸟食果木，筑巢大树，尽可能与自然环境融为一体。该区域最大限度保留了原生态植被和水体，必须人工修饰的地方也尽量不破坏原有的自然结构，不留下人为雕琢的痕迹，区城内集中着我市城区最完整的涉禽鸟类生态系统，经调查该片区城常年栖息鸟类170余种，还存在具有重大保护价值的物种，包括全球濒危种青头潜鸭等、区域罕见物种黑伯劳等，甚至有安徽省新分布记录鸟种被发现，具有较显著的生物多样性保护值。长888米的汀步，采用天然石材，汀步两侧撒有大量松果菊、百日菊，金鸡菊、蛇目菊等花种，这些花卉容易与周边植被融为一体，给人浑然天成的观赏感受。原木结构的观鸟塔位于既是以观鸟活动为中心的园林服务设施，也增加了湖面现有景观的层次。站在观鸟塔上，整个西湖湿地的最观尽收眼底，美不胜收。